วัดบางภาษีเป็นวัดในยุคแรกที่ทำการก่อสร้างวัดไม่ปรากฏหลักฐานว่าใครเป็นผู้สร้าง ที่ดินที่ทำการก่อสร้างเป็นผู้ใดและก่อสร้างเมื่อใดไม่ปรากฏหลักฐานตั้งแต่ได้รับ พระราชทานวิสุงคามสีมาจาก พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาประชาธิปก พระปกเกล้าเจ้าอยู่หัวรัชกาลที่ ๗ เมื่อวันที่ ๘ เมษายน พ.ศ.๒๔๗๒ ตามหลักฐานที่ได้รับพระราชทานวิสุงคามสีมาชื่อว่า “วัดปากคลองบางภาษี” ตั้งอยู่บริเวณปากคลองบางภาษี อำเภอบางปลา (บางเลน) จังหวัดนครชัยศรี (นครปฐม)

     จากคำสันนิฐานของผู้สูงอายุเชื่อว่า วัดปากคลองบางภาษี นั้นเนื่องมาจากในการก่อสร้างวัด มีผู้มีจิตศรัทธา สาธุชนร่วมกันก่อสร้างวัดหลายคน การตั้งชื่อวัดจึงมิได้ตั้งชื่อตามชื่อของผู้ก่อตั้งวัดและเพื่อให้เกิดศรัทธาแก่สาธุชน โดยทั่วไปจึงตั้งชื่อวัดตามตำบลที่ตั้งของวัดประกอบกับที่ตั้งของวัดอยู่บริเวณปากคลองริมแม่น้ำท่าจีน(แม่น้ำนครชัยศรี) จึงตั้งชื่อว่า “วัดปากคลองบางภาษี” ในสมัยนั้นในปัจจุบันได้เปลี่ยนมาเป็น “วัดบางภาษี” ไม่ปรากฏหลักฐานแน่ชัดว่า คำว่า “ปากคลอง” หายไปเมื่อไรคงชื่อว่าวัดบางภาษีมาจนถึงปัจจุบันสมัยก่อนมีเรื่องที่น่าพอฟังได้อยู่ว่าขับเสภาขุนช้าง-ขุนแผน ที่ตรงนี้เป็นด่านเก็บภาษีราษฎร์จึงได้ตั้งชื่อวัดว่า “วัดบางภาษี” ตั้งแต่นั้นมาต่อมาแบ่งการปกครองใหม่ ตำบลบางภาษีถูกแบ่งออกเป็น๒ตำบลบริเวณที่ตั้งวัดบางภาษี ได้เปลี่ยนชื่อตำบลคลองนกกระทุง อำเภอเปลี่ยนจากอำเภอบางปลาเป็น “อำเภอบางเลน” แต่ตั้งชื่อวัดบางภาษี ก็ไม่ได้เปลี่ยนแปลงไปตามชื่อทาง เขตการปกครองทางราชการแต่อย่างไร ยังคงเรียกชื่อวัดว่าวัดบางภาษี มาจนตราบเท่าทุกวันนี้